中压紫外线杀菌器有效改善水质的紫外线穿透率。穿透率是评估水质的标准之一，当紫外线透过水层，由于水中的物质（无机或者有机物质）会吸收紫外线光强，从而降低紫外线的强度。而穿透率与浊度仅是对水中悬浮物的表征，其不代表水中的溶解物质。紫外线可以氧化水中的有机物，还可以破坏部分能导致水中浑浊物质的结构，从而与过滤工艺相结合可以不断的提高水质的穿透率。